口袋奇兵中的军阵系统最高可达到9级，但需要消耗大量材料和持续积累资源。根据游戏内数据，5级军阵需要2个突击阵研究手册和20个通用手册；6级军阵需要50个图纸；7级军阵则需要100个图纸。后续升级所需材料呈倍数增长，9级军阵需消耗10张突击阵图纸和200张通用图纸。军阵每提升一级都会显著增强兵种属性，例如1级军阵可使第一排士兵攻击力增加40%。
军阵解锁需先建造专用建筑，通过军团商店每日购买材料逐步升级。主要获取途径包括军团商店每日限购、挖矿大亨活动产出以及金融中心兑换。军阵材料存在每日获取上限，建议优先完成军团商店的每日采购。突击阵研究手册这类关键材料需参与限时活动获取，普通玩家平均需要24小时才能通过挖矿大亨活动收集足够数量。
游戏内存在多种军阵类型，包括突击阵、攻坚阵、狂鲨军阵、毒蝎军阵和战鹰军阵等。突击阵侧重提升前排攻击力，适合多数战斗场景；攻坚阵通过牺牲部分攻击换取生存能力，更适合防守战。高级军阵如狂鲨军阵具备战备位功能，能在士兵阵亡时即时补充兵力；毒蝎军阵擅长反击伤害；战鹰军阵则能削弱兵种克制效果。专精5级后的军阵会激活额外特效，如伤害加深或减免效果。
军阵升级优先级低于英雄培养和机甲强化，但高于兵种装备。对于资源有限的玩家，建议先将主力军阵升至5级激活专精效果，再逐步提升其他军阵。每日坚持完成军团商店采购和挖矿活动，约3个月可将核心军阵升至满级。守城时需注意重新设置军阵配置，系统默认不会自动应用最新军阵效果。当前版本存在军阵配置重置的BUG，建议每次登录后检查编队设置。
军阵科技与军阵等级相辅相成，建议同步提升。12-12-29的科技配置是性价比选择，可平衡攻防属性。参与英雄归来等活动时，可兑换军阵相关资源。需军阵效果在PVP和PVE中存在差异，攻坚阵在防守战中的表现优于突击阵。游戏后期更考验军阵搭配策略，单一高等级军阵不如多类型军阵的组合应用。
